비파엽이 피부 각질 세포의 유전자 발현에 미치는 영향
Effects of Eriobotryae Folium (EF) on Gene Expression in Human HaCaT keratinocyte
- 주제(키워드) 비파엽 , Eriobotryae Folium , 피부 각질 세포 , 유전자 발현 , Gene Expression , Human HaCaT keratinocyte
- 발행기관 동신대학교 대학원
- 지도교수 박혜선
- 발행년도 2009
- 학위수여년월 2009. 8
- 학위명 박사
- 학과 대학원 한의학과
- 세부전공 사상의학
- 원문페이지 ⅱ, 58p.
- 파일정보 한글 HWP (ver. 6.5.0.825), Adobe PDF (ver. 8.0.0.)
- 실제URI http://www.dcollection.net/handler/dsu/000000496944
- 본문언어 한국어
- 저작권 동신대학교 논문은 저작권에 의해 보호받습니다.
초록/요약
ABSTRACT Effects of Eriobotryae Folium (EF) on Gene Expression in Human HaCaT keratinocyte Kim Shin Dept. of Oriental Medicine Graduate School of Dongshin University (Directed by Prof. Park Hye-sun, O.M.D., Ph. D.) In the theory of traditional medicine, Eriobotryae Folium (EF) has been used to treat patients with cough in oriental countries. EF can clear away lung-heat, resolve phlegm, alleviate cough and lower the adverse-rising qi and arrest vomiting. Recently, EF is known to have anti-oxidantic action. For this reason, the present author designed to investigate the effects of EF on cell viability and proliferation rates of HaCaT keratinocyte, then effects on changes in genetic profile by EF. So, the genetic profile for the effect of EF on human derived HaCaT keratinocyte was measured using microarray technique, and the functional analysis on these genes was conducted. Total 536 genes were up-regulated and 587 genes were down-regulated in cells treated with EF. Genes induced or suppressed by EF were all mainly concerned with cellular metabolic process, primary metabolic process, protein binding, ion binding and cell part. Comparison study showed that expression levels of genes related regulation of molecular function and microfilament motor activity were elevated, on the other hand, those related membrane bound organelle were lowered significantly. The network of total protein interactions was measured using cytoscape program, and some key molecules, such as DAB2, JAK2, SOCS1, NRIP1, IRS1, APBB1, SIAH1 and MUC1 that can be used for elucidation of therapeutical mechanism of medicine in future were identified. These results suggest the possibility that EF can repair skin damage and also suggest that related mechanisms are involved in MET, MYO5A, MYO5B and JAK2 related signalling pathways.
more목차
ABSTRACT ----------------------------------------- ⅰ
Ⅰ. 서 론 ------------------------------------------ 1
Ⅱ. 재료 및 방법 ------------------------------------- 3
1. 재료 --------------------------------------------- 3
1) 세포주 ------------------------------------------ 3
2) 약재 -------------------------------------------- 3
3) 시약 및 기기 ------------------------------------- 3
2. 방법 --------------------------------------------- 4
1) 세포주 배양 환경 --------------------------------- 4
2) 약물의 준비 -------------------------------------- 4
3) 세포 증식율 측정 --------------------------------- 4
4) RNA 분리를 위한 약물 처리 및 실험군 분류 ---------- 5
5) RNA 분리 --------------------------------------- 5
6) RNA 추출 정도 관리 ------------------------------ 6
7) DNA 칩을 이용한 실험 ---------------------------- 6
8) 데이터 분석 ------------------------------------- 6
3. 통계처리 ----------------------------------------- 7
Ⅲ. 성 적 ------------------------------------------- 8
1. 세포의 생존율에 미치는 영향 ---------------------- 8
2. 세포의 증식율에 미치는 영향 ---------------------- 10
3. 추출된 RNA의 정도관리 결과 ---------------------- 12
4. DNA 칩 이미지 ----------------------------------- 15
5. DNA 칩에서의 신호강도 (signal intensity) 분포의 표준화
------------------------------------------ 17
6. 발현이 증가된 유전자들에 대한 기능 분석 ----------- 20
7. 발현이 감소된 유전자들에 대한 기능 분석 ----------- 24
8. 생물학적 과정, 분자기능 및 세포 구성요소 항목에서의 기능
분포 비교 --------------------------------------- 28
9. 발현이 증가된 유전자들에 의하여 발현되는 단백질 상호작용
네트워크 분석 ----------------------------------- 32
10. 발현이 감소된 유전자들에 의하여 발현되는 단백질 상호
작용 네트워크 분석 ------------------------------- 36
Ⅳ. 고 찰 ------------------------------------------ 40
Ⅴ. 결 론 ------------------------------------------ 48
참 고 문 헌 ----------------------------------------- 50